吃肉的熊貓 作品

第331章 申請授課!


  宋河順手開了一個新程序,按伊雷馬實驗室數據,同步復現藥物預測流程。

  別人做的成果,他不敢全盤接收,還是親自上手驗證一下穩妥!

  首先是經典的ddis預測,即藥物-藥物相互作用,探討病人短時間服用多種藥物後,產生的複合效應。

  當初在京海大學實驗室,呂承恩講過中藥預測五原則,相反為制、相畏為制、相喜為制、相資為制、相惡為制,也是藥物和藥物相互作用的原理,只不過現代的ddis預測深入到分子層面了。

  之前宋河看相關論文時,見過基於圖卷積神經網絡的ddis預測,以及基於平衡理論的預測。

  前者太片面,只考慮鄰接矩陣元素。而後者則太絕對,總結起來就是“朋友的朋友是朋友”、“朋友的朋友是敵人”,但實際的藥物研發中,關係遠比平衡理論要錯綜複雜。

  電腦屏幕上,伊雷馬實驗室居然兩種方法都棄之不用,赫然使用了新方法進行ddis預測!

  宋河研讀許久,基本明白了思路……大數據庫推導!

  伊雷馬實驗室嘗試將海量化合物進行拓展,梳理出親戚關係,畫出一個壯觀的樹狀圖,每個枝丫都連接一種相似的化合物。

  之後,再通過已經確定的化合物藥用特性,大膽猜測未知化合物的藥效。

  這感覺好比,知道丈夫是生物學家,知道妻子是短跑運動員,於是便猜測這對夫妻將來的孫子能夠……一邊短跑衝刺一邊手拿顯微鏡觀察細菌……

  本質上還是瞎猜藥物,但在瞎猜中多了一絲絲牽強附會的推理。

  “好難!”宋河吐槽。

  他在帖子裡尋找伊雷馬實驗室用的大數據庫。

  找了半天……沒找到?

  “怪不得呢!原來公佈的只是邊緣數據,最核心的沒公佈啊!”宋河搖頭失笑。

  沒辦法,他只得嘗試自己蒐集數據庫。

  他先在網上尋找,用過相似工作方式的科研團隊。

  花了許久,總共找到兩個。

  一個是千度公司合作的研發團隊,通過大量食管癌病人的數據,尋找到22個顯著突變基因,隨後預測關聯出可行的藥物信息。

  一個是msk癌症中心,開發了一個體細胞突變相關的知識庫,收錄了大量靶向藥。

  “都是做癌症的數據庫,用不上啊!”宋河撓頭。

  思前想後,他掏出手機,找相曉桐老師場外求助。